시작프로그램이 자꾸 초기화됩니다(우분투 12.04)

안녕하세요, 더운 여름 막바지 잘 보내고 계신가요?

다름 아니라 우분투 12.04 에서, 시작프로그램 설정이 자꾸 초기화되는 문의드립니다
현재 노트북 사용중이라, 우측 한/영키가 허드키와 함께눌려서 xmodmap 명령을 시작프로그램에 넣어두곤 하거든요.
그런데 이번에 12.04 설치하면서 시작프로그램에 xmodmap 넣어두고, 카이로독 부팅시 시동을 설정을 했는데
시작프로그램에 등록해두고 창 닫았다가 다시 시작프로그램 켜 보면 없어 져 있습니다ㅠㅠ

최근에 한 작업이라고는 기본 계정을 루트 계정으로 만들었다가 복구했던게 전부인데요ㅠㅠ…
무슨 문제가 있는 걸까요ㅠ…
(루트 권한 부여는 passwd user :x:0:0::/home/user:/bin/bash 으로 수정하는 방식을 썼었습니다