클라우드 환경에서 리눅스 백업 및 복구

안녕하세요
현재 모 클라우드에서 우분투를 사용 중입니다.
오류가 발생하거나 불필요한 파일들을 한방에 지우고 싶을 때
유****의 경우 서버의 삭제와 재설치를 웹 콘솔로 할 수 있었는데
옮긴 이곳은 OS재설치 비용이 청구되어 백업 및 복구할 방법을 찾고 있습니다.

ghost와 같이 포맷한것처럼 복구되기를 원하지만 부팅모드로 못들어감(SSH 접속만 가능) 문제가 있고
tar 백업의 경우 현재 파일들과는 관계없이 덮어씌어지는 형태라 기존 파일들이 지저분한 느낌이 있네요

좋은 백업&복구 방법에 대해 조언해주시면 감사하겠습니다 :D